創建はあまりに古く定かではありませんが、社伝によると垂仁天皇の御代に創建されたといわれ、９２７年に制定された『延喜式』にその名が記される多摩地方有数の古社です。１４７７年に多摩川の洪水を避け、古天神というところから現在の地に遷座されました。

布多天神社には薬祖神・少彦名神と、学問の神様として名高い菅原道真が祀られており、特に受験シーズンには多くの受験生が合格祈願に訪れます。